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热图tHeatmap差异基因表达
生成一个热图(heatmap),用于可视化基因在不同细胞群(clusters)中的表达模式。
热图将展示:
每个基因在不同细胞群中的表达水平。
细胞按聚类分组,顶部可能有颜色条表示聚类信息。
基因按表达模式排序,便于观察标记基因。
行(Rows):
每一行代表一个基因(来自 top5_markers$gene)。
基因的顺序通常是按聚类或表达模式排序的。
列(Columns):
每一列代表一个细胞(或细胞群,取决于 Seurat 对象的设置)。
默认情况下,细胞会按聚类(cluster)分组。
颜色:
颜色表示基因的表达水平:
红色:高表达。
蓝色:低表达。
白色:中等表达。
feb25
class practice
DotPlot-差异基因注释
这段代码将生成一个点图,其中
x 轴代表聚类。
y 轴代表前 5 个标记基因。
点的大小与表达该基因的细胞百分比相对应。
颜色强度对应基因的平均表达水平。