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统计
统计
ROC and DCA
ROC
DCA
颜色获取
plot()
预后评估模型及预后模型的统计学评价
Nomogram
c-index
calibrate
ROC
DCA
临床资料处理
从TCGA下载临床信息后,经过处理,用于制作三表
COX回归
单因素、多因素COX
ID转换
利用{clusterProfile} 和 【bitr()】进行ID转换
3种方法进行差异分析
DESeq; edgeR; limma
可视化初阶
分组箱型图、小提琴图、直方图、密度图、聚类分析、相关性分析、PCA
GEO差异分析
GEO差异分析的过程;
结果输出:差异表达矩阵+筛选出来的差异表达基因