本教程展示了如何使用 Seurat (>=3.2) 分析空间解析 RNA 测序数据。

使用 CellChat v2 进行细胞间通信的推断和分析

通过 ggplot2 画热图

purrr 包 map 函数家族

手搓矩阵相关算法及函数。

R 中的线性代数相关操作

创建 SeuratObject 的教程

本笔记记录了绘制箱线图的代码示例。

本笔记记录了一个使用ggplot2和ggpubr包创建带有线性拟合曲线和相关系数及p值标注的散点图的示例。

运用TCGA数据集针对临床信息及基因表达进行预后分析。

一行代码得到处理好的 TCGA 数据集

ggbetweenstats() 的用法

如何创建 SeuratObject？

使用 ggplot2 画条形图

本笔记的目的在于对下载好的 TCGA 乳腺癌数据集进行指控以及差异分析（肿瘤 vs 正常）。

本笔记的目的为记录获取 TCGA 中乳腺癌的转录组测序数据，为后续的分析做准备。