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Seurat 分析空间组学：Visium 篇
本教程展示了如何使用 Seurat (>=3.2) 分析空间解析 RNA 测序数据。
使用 CellChat v2 进行细胞间通信的推断和分析
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热图
通过 ggplot2 画热图
将函数应用于向量的每个元素
purrr 包 map 函数家族
手搓矩阵相关算法及函数
手搓矩阵相关算法及函数。
R 中的线性代数相关操作
R 中的线性代数相关操作
创建 SeuratObject
创建 SeuratObject 的教程
箱线图
本笔记记录了绘制箱线图的代码示例。
相关性散点图
本笔记记录了一个使用ggplot2和ggpubr包创建带有线性拟合曲线和相关系数及p值标注的散点图的示例。
生存分析
运用TCGA数据集针对临床信息及基因表达进行预后分析。
easyTCGA
一行代码得到处理好的 TCGA 数据集
ggbetweenstats()
ggbetweenstats() 的用法
创建 SeuratObject
如何创建 SeuratObject？
ggplot2 条形图
使用 ggplot2 画条形图
TCGA 差异分析
本笔记的目的在于对下载好的 TCGA 乳腺癌数据集进行指控以及差异分析（肿瘤 vs 正常）。
TCGA 数据获取
本笔记的目的为记录获取 TCGA 中乳腺癌的转录组测序数据，为后续的分析做准备。